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Institute of Theoretical Physics, Academia sinica, PO Box 2735, Beijing 100080


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My research fields

Surface physics

Stochastic processes

Nonliear dynamics, Symbolic dynamics

Statistical Physics

 

工作履历

1978.1 -- 1979.5 中国科学院物理研究所

1979.5 --        中国科学院理论物理研究所

1981.9 -- 84.121985.7 -- 87.8 美国德州大学奥斯汀统计力学中心

2001.11 – 北京华大基因中心生物信息学顾问

专业:非线性动力学,统计物理,生物信息学

在随机过程、非线性动力学和半经典理论等领域发表论文百篇及专著两部。目前研究方向为蛋白质结构预测和基因组序列注释。

主要学术成果
1.
量子物理学及相关问题
一维薛定锷方程双势准确解模型、一维福克-普朗克方程的双势可解模型、微波场中氢原子的能级混合、准晶链Fibonacci模型能谱全局标度性质、谱密度魏耳展开长度项的半经典理论。
2.
非线性动力学
一维映射符号动力学:周期窗口定理、揉序列广义合成律、圆映射符号动力学、标准映射参数重正化群、轨道维数的集团平均场重正化群计算;二维耗散映射符号动力学及其在微分动力系统中的应用;运动场台球模型二维保守系统符号动力学;其它:Eden生长模型集团回转比1/D修正、方波驱动随机共振模型。
3.
与生命科学有关问题
生物膜液晶模型Helfrich轴对称膜泡方程的初积分、分子动力学多重采样算法的温度悖逆问题、基于动态规划的蛋白质二级结构预测、基于相似性的生物序列模式搜寻、结构码和基于结构码的蛋白质结构快速联配。

My publication list

Video

SLIDES

1. Fast protein structure alignment PPT

2. HMM for protein secondary structure PPT

3Lecture note for SISSA PPT

Supplementary Material for Counting of oligomers in

sequences generated by Markov chains

1. Source code in c

2. Supplementary

Fast Multiple Alignment of Protein StructuresBLOMAPS

 

E-mail: zheng*AT*itp.ac.cn
Amino acid sequences of PDBselect 
Secondary structure sequences of PDBselect